SHY: Tokyo Dakkan-hen

Po zmaganiach z tajemniczym 'Amalareik' i jego liderem, Stigmą, Shy powraca do Japonii, gdzie spotyka Ai Tennouji – dziewczynę, która uciekła ze swojej wioski ninja. Ai wyjawia Shy, że opuściła wioskę, by ścigać członka 'Amalareik'. Wkrótce Tokio zostaje nagle pochłonięte przez czarną kulę i znika, co zmusza bohaterów do podjęcia desperackiej misji ratunkowej. Czy uda im się odzyskać miasto i odkryć prawdę stojącą za tym kataklizmem?